Trong quá trình kinh doanh, Trần Đình Dũng đã chỉ đạo xuất khống hơn 15.000 hóa đơn cho 623 doanh nghiệp để trốn thuế giá trị gia tăng với tổng số tiền khoảng 14,62 tỉ đồng.